Перейти до основного вмісту

Відсоток ДНК покритий за допомогою ДНК родичів

 Уявимо ситуацію, що є людина, якої ми не можемо зробити тест ДНК. Наприклад людина вже померла. Але є її кілька родичів, для яким ми маємо ДНК тестів результати. Потрібно визначити скільки відсотків ДНК людини ми можемо відновити за ДНК її родичів.

Формула буде наступною C=1 - П(1-xi), де xi - це теоретична спільна ДНК ш-ї людини. П - це добуток значень.

Теоретичну спільну ДНК ми можемо знайти взявши теоретичну середню кількість спільного ДНК для певного ступеня спорідненості з сайту DNA Painter і щоб cM перевести у % потрібно скористатись формулою p=s/(2*M), де M=3487 - константа.

Отже маємо людину, для якої не маємо тесту ДНК і її родичів: сина(50%), доньку(50%), племінника(25%), тоді у нас є можливість відновити 81.24% ДНК цієї людини.

Приклади розрахунків у Google Spreadsheet (можете зробити копію і внести свої дані)


У GedMatch є інструмент Lazarus, який дозволяє відновити ДНК людини за ДНК її родичів. 

Мітки:

Коментарі

Дописати коментар

Популярні дописи з цього блогу

Швидкий старт у генеалогії: як дослідити своїх предків на прикладі Володимирського повіту

Цікавитесь своїм родоводом, але не знаєте, з чого почати? Розпочати генеалогічне дослідження простіше, ніж здається! Особливо якщо ваші предки були з Володимирського повіту на Волині. Ось покрокова інструкція, яка допоможе вам зробити перші впевнені кроки 👣 1. 📌 Почніть з розпитувань у родині Поговоріть з рідними, особливо зі старшими. Дізнайтеся: Імена ваших предків (бабусь, дідусів, прадідів) Де вони жили? Якого були віросповідання? У яку церкву ходили? Ці прості питання допоможуть вам визначити парафію , до якої належали ваші предки. 2. 🗺 Знайдіть свою парафію Парафія — це ключ до церковних записів. Для її пошуку скористайтесь: 🗺 Карта парафій Волині : tinyurl.com/ua-parishes 3. 📄 Перевірте сповідні відомості Це надзвичайно корисний ресурс! 📘  Довідник сповідних відомостей Володимирського повіту :  tinyurl.com/volodymyr-spovidky У багатьох парафіях Волині різного часу відбувались переписи всіх прихожан . Там можна знайти: Склад родини Вік ...
Дописати коментар
Докладніше

MDS карта збіженців

Пропоную вашій увазі спосіб розміщення збіженців в системі координат. Використовується метод Multidimensional Scaling з бібліотеки sklearn. Аналогічно, як у Ancient Origins карта генетичних відстаней у МyHeritage, тільки тут показують зв'язки між вами і збіженцями. Що можна сказати про це представлення Ви знаходитесь у центрі координат (оранжева крапка) Можна задати одного зі своїх батьків (або когось з близьких родичів цих батьків), і відстань до нього (наприклад 1.0 - одне покоління для когось з батьків), наприклад це буде мати. Тоді мати буде в точці (1;0) З великою натяжкою можна стверджувати, що права половина точок - збіги пов'язані з матір'ю, а ліва половина з батьком. В реальності це представлення є неближенням, тому в реальності межа може бути трохи іншою (див нижче приклад для мого випадку)  В системі координат 4 квадранти і кожен з них (приблизно) може відповідати комусь із ваших дідусів-бабусь Теоретично можна побудувати 3-вимірне (чи навіть більше представлен...
Дописати коментар
Докладніше

Ймовірність зв'язку зі збіженцем через прямі батьківські лінії

Ймовірність того, що певний збіженець є родичем за прямими батьківськими лініями з вами приблизно залежить від значення спільного ДНК в сантиморганах. Чим ближчий родич, ти більша така ймовірність. Доречі, всі ці міркування вірні і якщо брати прямі материнські лінії, але для простоти будемо говорити тут про батьківські. На цьому зображенні всі блакитні люди - родичі за прямими батьківськими лініями, чоловіки з цієї групи мають спільну з вами Y-гаплогрупу. Всі рожеві люди - родичі за прямими материнськими лініями і всі вони (чоловіки і жінки) мають спільну з вами Mt-гаплогрупу. P(x) - це така ймовірність, вона вираховується за формулою: M - константа, число спільного ДНК між дитиною і батьком/матір'ю. Наприклад для 40 сМ наша ймовірність буде 1.16% . Знаючи формулу ймовірності можемо порахувати скільки всього приблизно серед ваших збіженців таких, з ким ви пов'язані батьківськими лініями. Для цього нам потрібно знати загальну кількість збіженців ( N ) та розмір медіального ...
1 коментар
Докладніше